- Рентгенхирургическое отделение
- Отделение опухолей костей, кожи и мягких тканей
- Онкоурологическое отделение
- Эндохирургическое отделение
- Отдел радиотерапии
- Отделение радиотерапии №1 (гинекологического профиля)
- Отделение торакальное онкологическое №1
- Отделение торакальной хирургии №2
- Отделение онкологическое абдоминальное
- Отдел онкогинекологии
- Отделение опухолей головы-шеи
- Отдел противоопухолевой лекарственной терапии
- Отделение анестезиологии-реанимации №1
- Оперблок №1
- Отделение анестезиологии-реанимации №2, оперблок №2
- Поликлиническое отделение
- Отдел радиоизотопной и УЗИ-диагностики
- Отделение функциональной диагностики
- Эндоскопическое отделение
- Отделение лучевой диагностики и компьютерной томографии
- Лаборатория молекулярной диагностики
- Клинико-диагностическая лаборатория
- Цитологическая лаборатория
- Патологоанатомическое отделение